RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 FGAP02671 866 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 CHMP4BP1P59074 171 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 LRRC24Q50LG9 513 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 FOXR1Q6PIV2 292 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 CNNM3Q8NE01 707 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ALG1Q9BT22 464 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 CUTAO60888 179 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ZNF18P17022 549 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ACTN2P35609 894 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 FOXO4P98177 505 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 MED15Q96RN5 788 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PRR29P0C7W0 189 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 KRT40Q6A162 431 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 BRD3Q15059 726 aa23.47■■□□□ 1.35
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PMS1-222ENST00000639501 CERS3Q8IU89 383 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 PHKBQ93100 1093 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.47■■□□□ 1.35
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PMS1-222ENST00000639501 ALS2Q96Q42 1657 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 CCDC102BQ68D86 513 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 MYO1BO43795 1136 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 IQUBQ8NA54 791 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-222ENST00000639501 A0A1B0GUL7 405 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 GRIN1Q05586 938 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 WASHC4Q2M389 1173 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 SENP2Q9HC62 589 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 JMYQ8N9B5 988 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 NCOA7Q8NI08 942 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 NBPF3Q9H094 633 aa23.43■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 CPDO75976 1380 aa23.43■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 TEX33O43247 280 aa23.42■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 SCARF1Q14162 830 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 L1RE1Q9UN81 338 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 ADORA1P30542 326 aa23.41■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 GPR108Q9NPR9 543 aa23.41■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 NR1I3Q14994 352 aa23.4■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 SPEF2Q9C093 1822 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 SLIT3O75094 1523 aa23.4■■□□□ 1.34
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PMS1-222ENST00000639501 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PMS1-222ENST00000639501 MICU3Q86XE3 530 aa23.39■■□□□ 1.34
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