RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 TTC22Q5TAA0 569 aa20.68■□□□□ 0.9
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PTPRJ-207ENST00000613246 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-207ENST00000613246 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-207ENST00000613246 CLCN1P35523 988 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT12Q99456 494 aa20.67■□□□□ 0.9
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.65■□□□□ 0.9
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PTPRJ-207ENST00000613246 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRJ-207ENST00000613246 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.64■□□□□ 0.9
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PTPRJ-207ENST00000613246 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-207ENST00000613246 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-207ENST00000613246 RAP1GDS1P52306 607 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-207ENST00000613246 EXOC5O00471 708 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-207ENST00000613246 HIP1RO75146 1068 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-207ENST00000613246 ELP1O95163 1332 aa20.61■□□□□ 0.89
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