RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589627.1

VASP-208, Transcript of vasodilator stimulated phosphoprotein, human

TSL 3

Gene VASP, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VASP-208	ENST00000589627	SP3	Q02447	781 aa		29.19	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		29.19	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		29.19	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	CENPF	P49454	3210 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	RHBDL3	P58872	404 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	CAP1	Q01518	475 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	TNNI3K	Q59H18	835 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		29.18	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		29.17	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	MAP3K10	Q02779	954 aa		29.17	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		29.17	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		29.16	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	BTBD19	C9JJ37	291 aa		29.16	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		29.16	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		29.15	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	GSTO1	P78417	241 aa		29.14	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		29.14	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	SIPA1L1	O43166	1804 aa		29.14	■■■□□ 2.26
VASP-208	ENST00000589627	LDHC	P07864	332 aa		29.13	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	CEP85	Q6P2H3	762 aa		29.13	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	EFCC1	Q9HA90	598 aa		29.13	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	TLR2	O60603	784 aa		29.12	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	MOGS	Q13724	837 aa		29.12	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	PICALM	Q13492	652 aa		29.11	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		29.11	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		29.11	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		29.11	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	PANK1	Q8TE04	598 aa		29.11	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	RAI14	Q9P0K7	980 aa		29.11	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		29.1	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	MGAM	O43451	1857 aa		29.09	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		29.09	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	SLURP2	P0DP57	97 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	SNRK	Q9NRH2	765 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
VASP-208	ENST00000589627	CXCL11	O14625	94 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	TBC1D12	O60347	775 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	IGSF3	O75054	1194 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	BRCA2	P51587	3418 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	PTPRA	P18433	802 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	ARMC5	Q96C12	935 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	PDHX	O00330	501 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	MS4A1	P11836	297 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	ARHGEF6	Q15052	776 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	C17orf99	Q6UX52	265 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	PICK1	Q9NRD5	415 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	MYH1	P12882	1939 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	ZAP70	P43403	619 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	TEX11	Q8IYF3	940 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	PPP4C	P60510	307 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VASP-208	ENST00000589627	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	29.01	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		29	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	FAM196B	A6NMK8	535 aa		28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	BAG3	O95817	575 aa		28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	GNRH1	P01148	92 aa		28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	PLCG2	P16885	1265 aa		28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	KIF22	Q14807	665 aa		28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23

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