RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553025.5

ANKRD13A-208, Transcript of ankyrin repeat domain 13A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD13A, Length 1,455 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13A-208ENST00000553025 MYO1BO43795 1136 aa13.14□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 NECTIN1Q15223 517 aa13.14□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.14□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.14□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.14□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 MAST2Q6P0Q8 1798 aa13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 IQCA1LA6NCM1 817 aa13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 USP5P45974 858 aa13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 SBK1Q52WX2 424 aa13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 KCNB2Q92953 911 aa13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 FAM198AQ9UFP1 575 aa13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZMYM6O95789 1325 aa13.13□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TIAM2Q8IVF5 1701 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ENTPD3O75355 529 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 EPHX2P34913 555 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 HSPA4P34932 840 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 NFIAQ12857 509 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CTR9Q6PD62 1173 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 NAPBQ9H115 298 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.12□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CLRN2A0PK11 232 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 USP17L12C9JPN9 530 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 USP17L21D6R901 530 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CACNB3P54284 484 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 FAM83AQ86UY5 434 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 MCM9Q9NXL9 1143 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TMOD2Q9NZR1 351 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 FLT1P17948 1338 aa13.11□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 SLC27A2O14975 620 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TDO2P48775 406 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 C12orf60Q5U649 245 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CREB3L3Q68CJ9 461 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 FAM151AQ8WW52 585 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TCP10L2B9ZVM9 353 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZNF213O14771 459 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CYP21A2P08686 494 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 PICALMQ13492 652 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 RNF20Q5VTR2 975 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 IL17RAQ96F46 866 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 RRAGCQ9HB90 399 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 PALD1Q9ULE6 856 aa13.1□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CNTNAP1P78357 1384 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 MCCP23508 829 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 PLCD1P51178 756 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TCP10Q12799 353 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TNFAIP1Q13829 316 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 TTC6Q86TZ1 520 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 RASEFQ8IZ41 740 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 VEZTQ9HBM0 779 aa13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ANKRD13A-208ENST00000553025 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 MINDY4BA8MYZ0 360 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 FGRP09769 529 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 CYP2D6P10635 497 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 TNNI2P48788 182 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 ANAPC15P60006 121 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 PPARAQ07869 468 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 RASA3Q14644 834 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 WDR90Q96KV7 1748 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 NBPF3Q9H094 633 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 SMIM22K7EJ46 135 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 HAND2P61296 217 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD13A-208ENST00000553025 GGA3Q9NZ52 723 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms