RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 CXCL11O14625 94 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 AK9Q5TCS8 1911 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 COL6A3P12111 3177 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 CAPN2P17655 700 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 RNF208Q9H0X6 261 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 FCGRTP55899 365 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 UBXN2AP68543 259 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PRKCZQ05513 592 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 NFIAQ12857 509 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 POLA2Q14181 598 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 A0A0C4DFX4 3053 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 SGPL1O95470 568 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 CYP2C8P10632 490 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 RLBP1P12271 317 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 TCP10Q12799 353 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 SSH3Q8TE77 659 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PTPRFP10586 1907 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GUL7 405 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PPC1 479 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PHKA1P46020 1223 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ATP8B2P98198 1209 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 MAP3K10Q02779 954 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 CCDC102BQ68D86 513 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 GABRQQ9UN88 632 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 DOCK2Q92608 1830 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 MS4A1P11836 297 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PRDX5P30044 214 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 TIMM10P62072 90 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 TFCP2Q12800 502 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 IRF5Q13568 498 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 IDI2Q9BXS1 227 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 GPR108Q9NPR9 543 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 USP40Q9NVE5 1235 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ADCY3O60266 1144 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 PTPRAP18433 802 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ADORA1P30542 326 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.137e-8■■■□□ 15.6
CS-221ENST00000550734 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 XAGE2Q96GT9 111 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-221ENST00000550734 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.21□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 ENTPD3O75355 529 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 FLT3LGP49771 235 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 RASGRF1Q13972 1273 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 GAKO14976 1311 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 INHAP05111 366 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 PICK1Q9NRD5 415 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 ALPK3Q96L96 1907 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 DOCK1Q14185 1865 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 EVI5O60447 810 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-221ENST00000550734 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169 ms