RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 ERO1AQ96HE7 468 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 EFCC1Q9HA90 598 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 F8W031 263 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MYCP01106 439 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 ZNF333Q96JL9 665 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 GNAT2P19087 354 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 CYP7A1P22680 504 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 NF2P35240 595 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 TNNI2P48788 182 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 TNFAIP1Q13829 316 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 DACT2Q5SW24 774 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 NBPF11Q86T75 865 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MRIQ9BWK5 157 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 JAG2Q9Y219 1238 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 A0A1B0GUL6 1792 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 CDC45O75419 566 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 PRKG1Q13976 671 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 SPRYD7Q5W111 196 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 IFNL1Q8IU54 200 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MAGEB6Q8N7X4 407 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 HOOK2Q96ED9 719 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 LAMA3Q16787 3333 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 PDE4AP27815 886 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 INHBEP58166 350 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MECOMQ03112 1051 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 UBE3CQ15386 1083 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 COL4A1P02462 1669 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 REC8O95072 547 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 APPP05067 770 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 PDE6AP16499 860 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 SDSP20132 328 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 USP5P45974 858 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 CRKP46108 304 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 PI16Q6UXB8 463 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 APPBP2Q92624 585 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 LRCH3Q96II8 777 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-218ENST00000550159 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 MCCP23508 829 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 PRDX5P30044 214 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 ADD2P35612 726 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 SP3Q02447 781 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 CFAP100Q494V2 611 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 PRO3102Q9H379 93 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 RAD50Q92878 1312 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 BTDP43251 543 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 CRHR2Q13324 411 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 TEX11Q8IYF3 940 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 USP40Q9NVE5 1235 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 HLA-DOAP06340 250 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 CAP1Q01518 475 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 ARHGEF6Q15052 776 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-218ENST00000550159 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.5 ms