RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	BMP6	P22004	513 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	CDK5R2	Q13319	367 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	ADAMTS4	O75173	837 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	TRIM37	O94972	964 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	NEFM	P07197	916 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	ERVK-24	P63145	666 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	LRRC14	Q15048	493 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
QKI-213	ENST00000544361	WNT11	O96014	354 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	ISL2	Q96A47	359 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.2	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.19	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.19	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.19	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PRNP	P04156	253 aa		7.17	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	NTF4	P34130	210 aa		7.17	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PSMD2	Q13200	908 aa		7.17	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	CCDC27	Q2M243	656 aa		7.17	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	LEFTY1	O75610	366 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	LMNB1	P20700	586 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	IRAK1	P51617	712 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.16	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	FANCG	O15287	622 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	DAB2	P98082	770 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	RING1	Q06587	406 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	MCTP1	Q6DN14	999 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	FLCN	Q8NFG4	579 aa		7.15	□□□□□ -1.26
QKI-213	ENST00000544361	INPP5A	Q14642	412 aa		7.14	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.14	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.14	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		7.14	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	ABI1	Q8IZP0	508 aa		7.14	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.14	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	FBXL18	Q96ME1	805 aa		7.14	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	LIG3	P49916	1009 aa		7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	SEPT6	Q14141	434 aa		7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	HDX	Q7Z353	690 aa		7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		7.13	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	KCT2	Q8NC54	265 aa		7.12	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	NETO1	Q8TDF5	533 aa		7.12	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.12	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.12	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.12	□□□□□ -1.27
QKI-213	ENST00000544361		U3KQE9	123 aa		7.12	□□□□□ -1.27

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