RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.4■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.4■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 SP3Q02447 781 aa22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K10Q02779 954 aa22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 PANK1Q8TE04 598 aa22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.39■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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TM2D1-211ENST00000496465 MS4A1P11836 297 aa22.38■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.38■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 CEP85Q6P2H3 762 aa22.38■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.38■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM17Q9Y577 477 aa22.38■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.37■■□□□ 1.17
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TM2D1-211ENST00000496465 BTBD19C9JJ37 291 aa22.37■■□□□ 1.17
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TM2D1-211ENST00000496465 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.37■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 RAI14Q9P0K7 980 aa22.37■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 DOCK1Q14185 1865 aa22.37■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.36■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 SOX10P56693 466 aa22.36■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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TM2D1-211ENST00000496465 IGSF3O75054 1194 aa22.35■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 PICALMQ13492 652 aa22.35■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 SNRKQ9NRH2 765 aa22.35■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 FOCADQ5VW36 1801 aa22.35■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 TLR2O60603 784 aa22.34■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 CAP1Q01518 475 aa22.34■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.34■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 EFCC1Q9HA90 598 aa22.34■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 CENPFP49454 3210 aa22.33■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 TBC1D12O60347 775 aa22.33■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 MOGSQ13724 837 aa22.33■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.33■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.33■■□□□ 1.17
TM2D1-211ENST00000496465 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.32■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 CXCL11O14625 94 aa22.32■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.32■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.31■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 PTPRAP18433 802 aa22.31■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGEF6Q15052 776 aa22.31■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 PICK1Q9NRD5 415 aa22.31■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 SLURP2P0DP57 97 aa22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ZAP70P43403 619 aa22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 TEX11Q8IYF3 940 aa22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 SIPA1L1O43166 1804 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 PDHXO00330 501 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 BAG3O95817 575 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 PPP4CP60510 307 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.29■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 PLCG2P16885 1265 aa22.28■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 C17orf99Q6UX52 265 aa22.28■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.28■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 COG6Q9Y2V7 657 aa22.28■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.27■■□□□ 1.16
TM2D1-211ENST00000496465 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 AACSQ86V21 672 aa22.26■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.26■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 ARMC5Q96C12 935 aa22.26■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 GNRH1P01148 92 aa22.25■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 KIF22Q14807 665 aa22.25■■□□□ 1.15
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