RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21	2e-7	■□□□□ 9.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CETP	P11597	493 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP7A1	P22680	504 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	USP5	P45974	858 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PPAT	Q06203	517 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL15	Q16663	113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21	3e-6	■□□□□ 10.3
TTLL3-231	ENST00000496246	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP4C	P60510	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PPIL2	Q13356	520 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D12	O60347	775 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FKTN	O75072	461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN15	O75808	1086 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR25	O00155	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLIM4	O00461	696 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ERC2	O15083	957 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5J	P18859	108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	RHBDL3	P58872	404 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF22	Q14807	665 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	INPP5B	P32019	993 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL11	O14625	94 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	IRF6	O14896	467 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	HAUS7	Q99871	368 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	FLT1	P17948	1338 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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