RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 ZAP70P43403 619 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 GTF2A2P52657 109 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 RHBDL3P58872 404 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 AACSQ86V21 672 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ERO1BQ86YB8 467 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPN18Q99952 460 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 APBB1O00213 710 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 FKTNO75072 461 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 CCL15Q16663 113 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 PPIL2Q13356 520 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 IRF6O14896 467 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 PPATQ06203 517 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 CRHR2Q13324 411 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB11FIP3O75154 756 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 BAG3O95817 575 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 CETPP11597 493 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 SNAPC2Q13487 334 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX11Q8IYF3 940 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 IGSF3O75054 1194 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL11AQ9H165 835 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 FOCADQ5VW36 1801 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 SLURP2P0DP57 97 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 PLCG2P16885 1265 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K10Q02779 954 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 DOCK1Q14185 1865 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP7A1P22680 504 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP4CP60510 307 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 BTBD19C9JJ37 291 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 PICK1Q9NRD5 415 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D12O60347 775 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K12Q12852 859 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 ERO1AQ96HE7 468 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRFP10586 1907 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 MYH1P12882 1939 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM196BA6NMK8 535 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRAP18433 802 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 SP3Q02447 781 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 SIPA1L1O43166 1804 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 FLT1P17948 1338 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 CXCL11O14625 94 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM17Q9Y577 477 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-211ENST00000493436 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms