RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 MAP3K5Q99683 1374 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 GNAT3A8MTJ3 354 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 AMOTQ4VCS5 1084 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF787Q6DD87 383 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 TMC7Q7Z402 723 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 TSPYL6Q8N831 410 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 GPR152Q8TDT2 470 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 GJA3Q9Y6H8 435 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 GLI3P10071 1580 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 FANCIQ9NVI1 1328 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 EGFRP00533 1210 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 USP5P45974 858 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGGTB-212ENST00000491266 PDE3BQ13370 1112 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 LAMC2Q13753 1193 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 NGEFQ8N5V2 710 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 CEP63Q96MT8 703 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 BRD7Q9NPI1 651 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 MBIPQ9NS73 344 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 IL16Q14005 1332 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 E9PSI1 815 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 TREHO43280 583 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 BNIP3LO60238 219 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 DSC3Q14574 896 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 COL19A1Q14993 1142 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 GPR182O15218 404 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 EPB42P16452 691 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 AAMPQ13685 434 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 XKR5Q6UX68 686 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 IFT57Q9NWB7 429 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 SPG7Q9UQ90 795 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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RABGGTB-212ENST00000491266 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 LRRC37A3O60309 1634 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGGTB-212ENST00000491266 VAMP4O75379 141 aa7.96□□□□□ -1.14
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RABGGTB-212ENST00000491266 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 EHHADHQ08426 723 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC39A6Q13433 755 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM182BQ5T319 152 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 USP20Q9Y2K6 914 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 TNS2Q63HR2 1409 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 EXOC5O00471 708 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 PCSK2P16519 638 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGGTB-212ENST00000491266 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 PIGBQ92521 554 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 DCAF5Q96JK2 942 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 TNNQ9UQP3 1299 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 MRC1P22897 1456 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNQ2O43526 872 aa7.94□□□□□ -1.14
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