RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CERS3	Q8IU89	383 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP4C	P60510	307 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL15	Q16663	113 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF384	Q8TF68	577 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	OTUD5	Q96G74	571 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ERO1A	Q96HE7	468 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	RAI14	Q9P0K7	980 aa		21.15	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL11	O14625	94 aa		21.14	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	IRF6	O14896	467 aa		21.14	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	BAG3	O95817	575 aa		21.14	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		21.14	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		21.14	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		21.14	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		21.13	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	CRHR2	Q13324	411 aa		21.13	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	PI16	Q6UXB8	463 aa		21.13	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	21.13	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	21.13	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	INPP5B	P32019	993 aa		21.12	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	SP3	Q02447	781 aa		21.12	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		21.12	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		21.12	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB11FIP3	O75154	756 aa		21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	21.11	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	21.1	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		21.1	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	21.1	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		21.1	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		21.1	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	21.09	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR2	O60603	784 aa		21.09	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	GNRH1	P01148	92 aa		21.09	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		21.09	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	21.09	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	21.09	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		21.09	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	BTBD19	C9JJ37	291 aa		21.08	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	21.08	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	21.08	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		21.08	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	21.08	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	PICK1	Q9NRD5	415 aa		21.08	■□□□□ 0.97
HDAC10-216	ENST00000489424	ZAP70	P43403	619 aa		21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	GINM1	Q9NU53	330 aa		21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRA	P18433	802 aa		21.06	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		21.06	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX11	Q8IYF3	940 aa		21.06	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	EFCC1	Q9HA90	598 aa		21.06	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRK	Q9NRH2	765 aa		21.06	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		21.06	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX10	P56693	466 aa		21.05	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K12	Q12852	859 aa		21.05	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PICALM	Q13492	652 aa		21.05	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	AAMP	Q13685	434 aa		21.05	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	AACS	Q86V21	672 aa		21.05	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		21.05	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM17	Q9Y577	477 aa		21.05	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PRMT2	P55345	433 aa		21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	MOGS	Q13724	837 aa		21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		21.04	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF22	Q14807	665 aa		21.03	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf99	Q6UX52	265 aa		21.03	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	21.03	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		21.03	■□□□□ 0.96
HDAC10-216	ENST00000489424	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	21.02	■□□□□ 0.96

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