RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 MAP3K12Q12852 859 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 ELP3Q9H9T3 547 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.36e-7■■□□□ 14
NISCH-209ENST00000485765 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 PLCG2P16885 1265 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 CYP7A1P22680 504 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 SREBF2Q12772 1141 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 PICALMQ13492 652 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 WRNIP1Q96S55 665 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 TSKSQ9UJT2 592 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 CSADQ9Y600 493 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 TRPA1O75762 1119 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 TEX11Q8IYF3 940 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 OPTNQ96CV9 577 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 HAUS7Q99871 368 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 BCL11AQ9H165 835 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.14■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 OTOFQ9HC10 1997 aa23.14■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 GOLIM4O00461 696 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D12O60347 775 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 INPP5BP32019 993 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 CERS3Q8IU89 383 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 ERO1BQ86YB8 467 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 IFNL1Q8IU54 200 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 DOCK2Q92608 1830 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.11■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 PDE6AP16499 860 aa23.11■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.11■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.11■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 LAMB1P07942 1786 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 SLURP2P0DP57 97 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 PPATQ06203 517 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 GCC1Q96CN9 775 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 PTPN18Q99952 460 aa23.1■■□□□ 1.29
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NISCH-209ENST00000485765 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 AK9Q5TCS8 1911 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 FLT1P17948 1338 aa23.09■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 ALDH1A1P00352 501 aa23.09■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 GTF2A2P52657 109 aa23.09■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 PPIL2Q13356 520 aa23.09■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 OTUD5Q96G74 571 aa23.09■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.08■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 GPATCH3Q96I76 525 aa23.08■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.08■■□□□ 1.29
NISCH-209ENST00000485765 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.08■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 IRF6O14896 467 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D8O95759 1140 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 ADD2P35612 726 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 TNS4Q8IZW8 715 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.06■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.06■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.06■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.282e-7■■■□□ 15.8
NISCH-209ENST00000485765 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.285e-9■■■■□ 19.9
NISCH-209ENST00000485765 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.06■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.06■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 UBE3CQ15386 1083 aa23.05■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.05■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.05■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 PALD1Q9ULE6 856 aa23.05■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.04■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 CETPP11597 493 aa23.04■■□□□ 1.28
NISCH-209ENST00000485765 PTPRAP18433 802 aa23.04■■□□□ 1.28
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