RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD23Q86SG2 305 aa32.25■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF384Q8TF68 577 aa32.25■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF20L1A8MW92 1017 aa32.24■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDHCP07864 332 aa32.24■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP8B2P98198 1209 aa32.24■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSH3Q8TE77 659 aa32.24■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF22Q14807 665 aa32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC5Q96C12 935 aa32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR108Q9NPR9 543 aa32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAI14Q9P0K7 980 aa32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDHXO00330 501 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCAMP43121 646 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHBDL3P58872 404 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K10Q02779 954 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITPRIPQ8IWB1 547 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCYL3Q8IZE3 742 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf115Q9H7X2 142 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PICK1Q9NRD5 415 aa32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCL11O14625 94 aa32.21■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SURF6O75683 361 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOGSQ13724 837 aa32.2■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNNI3KQ59H18 835 aa32.2■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRP2BPQ9P2M1 347 aa32.2■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa32.2■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPM3O75607 178 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RLBP1P12271 317 aa32.19■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC39AQ5SRH9 613 aa32.19■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf99Q6UX52 265 aa32.19■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa32.19■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZHX2Q9Y6X8 837 aa32.19■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPFP49454 3210 aa32.19■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEFA5A3E0 1075 aa32.18■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC158Q5M9N0 1113 aa32.18■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa32.18■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPA4Q9UI42 421 aa32.18■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLURP2P0DP57 97 aa32.17■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRAP18433 802 aa32.17■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa32.17■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBNDD2Q9BQY9 259 aa32.17■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBED9Q6R2W3 1325 aa32.17■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNRH1P01148 92 aa32.16■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF11Q86T75 865 aa32.16■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRKQ9NRH2 765 aa32.16■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa32.16■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF333Q96JL9 665 aa32.15■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D12O60347 775 aa32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPAT2Q6NUI2 795 aa32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRA2Q96PE1 1338 aa32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOCK1Q14185 1865 aa32.14■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX11Q8IYF3 940 aa32.13■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM106CQ9BVX2 250 aa32.13■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRMT2P55345 433 aa32.12■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP32.12■■■□□ 2.732e-6■■■□□ 17.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GADL1Q6ZQY3 521 aa32.11■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMC4P43686 418 aa32.1■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAST2Q6P0Q8 1798 aa32.09■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM196BA6NMK8 535 aa32.09■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAG3O95817 575 aa32.09■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2C8P10632 490 aa32.09■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM47Q96LD4 638 aa32.09■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM75PA6NK02 468 aa32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EN2P19622 333 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTGFP29279 349 aa32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP85Q6P2H3 762 aa32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3TC2Q8TF17 1288 aa32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCG2P16885 1265 aa32.07■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXD10P28358 340 aa32.07■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PANK1Q8TE04 598 aa32.07■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHIPQ8WWQ0 1821 aa32.07■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC34A2O95436 690 aa32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms