RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 VPS16Q9H269 839 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 KIF3CO14782 793 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 BRD1O95696 1058 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SETDB1Q15047 1291 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IL17REQ8NFR9 667 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF4Q96M43 638 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 LONRF3Q496Y0 759 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC25Q86WR0 208 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NEK11Q8NG66 645 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 KRT23Q9C075 422 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 LTKP29376 864 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ESR2Q92731 530 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GUA9 196 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SWAP70Q9UH65 585 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 RPS6KB1P23443 525 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ELP1O95163 1332 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SSH2Q76I76 1423 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SLC27A2O14975 620 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CNGA1P29973 690 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.828e-9■■■□□ 15.5
PTPRM-202ENST00000400053 ATL3Q6DD88 541 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 METP08581 1390 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IL2RBP14784 551 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC63Q8NA47 563 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TNNI3KQ59H18 835 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP6O43182 974 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GAS8O95995 478 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 VIMP08670 466 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IQUBQ8NA54 791 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GPT2Q8TD30 523 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SUCLG2Q96I99 432 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM7Q9C029 511 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CSRNP2Q9H175 543 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CYP7A1P22680 504 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MCM7P33993 719 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 A6NNZ2 444 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TNNC1P63316 161 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MTX1Q13505 466 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ANO1Q5XXA6 986 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PSMB7Q99436 277 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SH3BP5O60239 455 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5DP30049 168 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP157Q5JU67 520 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 FAM227BQ96M60 508 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CLTCL1P53675 1640 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 EYA2O00167 538 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 JAK2O60674 1132 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms