RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 NCOA7Q8NI08 942 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 RPS6KB1P23443 525 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 RNF181Q9P0P0 153 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 KRT23Q9C075 422 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 FLT1P17948 1338 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF3Q9H094 633 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 PSME4Q14997 1843 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 SPDYE6P0CI01 402 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CPA1P15085 419 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD1Q15327 319 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 C12orf60Q5U649 245 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 GPC2Q8N158 579 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC14Q96N46 770 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 IDI2Q9BXS1 227 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 MCM5P33992 734 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 PICALMQ13492 652 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 SBF1O95248 1867 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 MYO1BO43795 1136 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC6Q86TZ1 520 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 H7C1D1 291 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 NT5C2P49902 561 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 FGD1P98174 961 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 PDE4BQ07343 736 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 TOMM22Q9NS69 142 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP2D6P10635 497 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 AK2P54819 239 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 MICALL2Q8IY33 904 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ENTPD3O75355 529 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 FGRP09769 529 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ESR2Q92731 530 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM2B-201ENST00000335523 B4E1Z4 1266 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 PRC1O43663 620 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 NFIAQ12857 509 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 INCENPQ9NQS7 918 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ORC4O43929 436 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 HLA-DOAP06340 250 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 Q6ZUG5 572 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 NEDD4P46934 1319 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC4A3P48751 1232 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 PLCD1P51178 756 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 CACNB3P54284 484 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXL16Q8N461 479 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 WNT10BO00744 389 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 KDM4AO75164 1064 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms