RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272369.13

MEIS1-201, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 4,291 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L15C9J2P7 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L10C9JJH3 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L12C9JPN9 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L11C9JVI0 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L21D6R901 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L18D6R9N7 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L22D6RA61 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L19D6RCP7 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L20D6RJB6 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 TIMM44O43615 452 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 VAMP4O75379 141 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 IL2RBP14784 551 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 USP17L24Q0WX57 530 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 TBX3O15119 743 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 UBE4AQ14139 1066 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 PHOX2BQ99453 314 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 MED14O60244 1454 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 DIP2AQ14689 1571 aa7.5□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ATP9BO43861 1147 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 RNF20Q5VTR2 975 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 E2F7Q96AV8 911 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ARHGEF10O15013 1369 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 STRN3Q13033 797 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 SETDB1Q15047 1291 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CTR9Q6PD62 1173 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 EFCC1Q9HA90 598 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 PTCH1Q13635 1447 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ESYT3A0FGR9 886 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 GNALP38405 381 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 SNX16P57768 344 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 KANK3Q6NY19 840 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 DPF3Q92784 378 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 TSPY26PQ9H489 355 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 MAP3K11Q16584 847 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 RNF135Q8IUD6 432 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 SPC24Q8NBT2 197 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CEP63Q96MT8 703 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 TINF2Q9BSI4 451 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.49□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CCDC96Q2M329 555 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 AACSQ86V21 672 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 VPS45Q9NRW7 570 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 BTG4Q9NY30 223 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 DCAF5Q96JK2 942 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CLUL1Q15846 466 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 ASIC2Q16515 512 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 Q3C1V9 767 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 LGR6Q9HBX8 967 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 TRIM17Q9Y577 477 aa7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 A0A087WZG4 1122 aa7.47□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 RAB27AP51159 221 aa7.47□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 GUCA2AQ02747 115 aa7.47□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 DDB1Q16531 1140 aa7.47□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 OXER1Q8TDS5 423 aa7.47□□□□□ -1.21
MEIS1-201ENST00000272369 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms