RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215956.9

SNU13-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNU13, Length 1,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13-201ENST00000215956 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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SNU13-201ENST00000215956 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.67□□□□□ -0.06
SNU13-201ENST00000215956 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SNU13-201ENST00000215956 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.67□□□□□ -0.06
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SNU13-201ENST00000215956 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNU13-201ENST00000215956 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.66□□□□□ -0.06
SNU13-201ENST00000215956 ST18O60284 1047 aa14.66□□□□□ -0.06
SNU13-201ENST00000215956 ATP2B3Q16720 1220 aa14.66□□□□□ -0.06
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SNU13-201ENST00000215956 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.66□□□□□ -0.06
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SNU13-201ENST00000215956 SNAP23O00161 211 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNU13-201ENST00000215956 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.64□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNU13-201ENST00000215956 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
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SNU13-201ENST00000215956 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNU13-201ENST00000215956 JAG2Q9Y219 1238 aa14.63□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNU13-201ENST00000215956 CCL15Q16663 113 aa14.62□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.62□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.62□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 GTF2A2P52657 109 aa14.61□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 RNF20Q5VTR2 975 aa14.61□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 OTUD5Q96G74 571 aa14.61□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 VGLL4Q14135 290 aa14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 TEPSINQ96N21 525 aa14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 SLC4A3P48751 1232 aa14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 16.8
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SNU13-201ENST00000215956 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 CSADQ9Y600 493 aa14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 COL6A3P12111 3177 aa14.59□□□□□ -0.07
SNU13-201ENST00000215956 AK9Q5TCS8 1911 aa14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 GOLIM4O00461 696 aa14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 FGFR2P21802 821 aa14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 MAP3K9P80192 1104 aa14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 KIF22Q14807 665 aa14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.58□□□□□ -0.08
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