RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 USP17L8P0C7I0 530 aa22.68■■□□□ 1.22
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IFRD1-201ENST00000005558 MCM2P49736 904 aa22.68■■□□□ 1.22
IFRD1-201ENST00000005558 SBK1Q52WX2 424 aa22.68■■□□□ 1.22
IFRD1-201ENST00000005558 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IFRD1-201ENST00000005558 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.68■■□□□ 1.22
IFRD1-201ENST00000005558 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.68■■□□□ 1.22
IFRD1-201ENST00000005558 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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IFRD1-201ENST00000005558 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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IFRD1-201ENST00000005558 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 9.3
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IFRD1-201ENST00000005558 KRT23Q9C075 422 aa22.57■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.57■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.57■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 TRDNQ13061 729 aa22.57■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.57■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 IDI2Q9BXS1 227 aa22.57■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.56■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 SPDYE6P0CI01 402 aa22.56■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 PICALMQ13492 652 aa22.56■■□□□ 1.2
IFRD1-201ENST00000005558 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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