RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640832.1

LINC01138-210, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1138, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01138, Length 1,709 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01138-210ENST00000640832 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01138-210ENST00000640832 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LINC01138-210ENST00000640832 SPTBP11277 2137 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 FHL1Q13642 323 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 FAM223BA6NKX1 122 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 COX7A2P2O60397 106 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 PRM2P04554 102 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 PROK2Q9HC23 129 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ZNF525Q8N782 197 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 A0A087X002 238 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 A0A0G2JRQ6 117 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 NNATQ16517 81 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 CD28P10747 220 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 Q6ZSV7 163 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 C20orf197Q8N268 126 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 CLPSP04118 112 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 PLGLAQ15195 96 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TWIST1Q15672 202 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 PATE2Q6UY27 113 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 CDK2AP2O75956 126 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 Q96M85 177 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 NABP2Q9BQ15 211 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ZNF702PQ9H963 129 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGHV3-9P01782 118 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV3-11P04433 115 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 SCXQ7RTU7 201 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 RYR1P21817 5038 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 FGF12P61328 243 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 Q8N3U1 123 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC01138-210ENST00000640832 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.4□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 SEC16AO15027 2179 aa6.4□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 H7C423 109 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV1D-33P01593 117 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV1-33P01594 117 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 IGKV1-16P04430 117 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 FCER1GP30273 86 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 CLEC2BQ92478 149 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 DYSFO75923 2080 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 A0A1W2PPR1 153 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 BGLAPP02818 100 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 PI3P19957 117 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.38□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 FREM3P0C091 2139 aa6.38□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 AGRNO00468 2067 aa6.38□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 ZNF138P52744 262 aa6.38□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 SYCNQ0VAF6 134 aa6.38□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.38□□□□□ -1.39
LINC01138-210ENST00000640832 A0A096LNJ9 63 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms