RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

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Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KDM5CP41229 1560 aa-2.54□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CUBNO60494 3623 aa-2.54□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-2.55□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IFNA17P01571 189 aa-2.55□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COX8AP10176 69 aa-2.55□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCL18P55774 89 aa-2.55□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRDM2Q13029 1718 aa-2.55□□□□□ -2.82
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF236Q9UL36 1845 aa-2.55□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 APLNQ9ULZ1 77 aa-2.55□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 R4GMQ9 66 aa-2.55□□□□□ -2.82
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A6NIN4 97 aa-2.56□□□□□ -2.82
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HSD11B1P28845 292 aa-2.56□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-2.56□□□□□ -2.82
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C10orf82Q8WW14 230 aa-2.56□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AKAP13Q12802 2813 aa-2.56□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PFDN1O60925 122 aa-2.57□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-2.57□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMED4Q7Z7H5 227 aa-2.57□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-2.57□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADGRB1O14514 1584 aa-2.57□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MYH13Q9UKX3 1938 aa-2.58□□□□□ -2.82
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LINC01545Q5VT33 79 aa-2.58□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-2.58□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRC1P22897 1456 aa-2.58□□□□□ -2.82
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 E7EQ34 232 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SMIM24O75264 130 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PITX3O75364 302 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PPP1R17O96001 155 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CTXN2P0C2S0 81 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 REEP5Q00765 189 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CALML5Q9NZT1 146 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STOML2Q9UJZ1 356 aa-2.6□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NIPSNAP2O75323 286 aa-2.61□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-2.61□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CLLU1Q5K131 121 aa-2.61□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STX12Q86Y82 276 aa-2.61□□□□□ -2.83
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-2.62□□□□□ -2.83
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-2.64□□□□□ -2.83
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TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PAEPP09466 180 aa-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UBE2G1P62253 170 aa-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BANF2Q9H503 90 aa-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PARVGQ9HBI0 331 aa-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PXDNQ92626 1479 aa-2.65□□□□□ -2.83
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DMXL1Q9Y485 3027 aa-2.66□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-2.66□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TEX15Q9BXT5 2789 aa-2.66□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLIT1O75093 1534 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HMGXB3Q12766 1538 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM78Q5T7P6 136 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ERCC6Q03468 1493 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADAMTS12P58397 1594 aa-2.67□□□□□ -2.84
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-2.67□□□□□ -2.84
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