RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-208ENST00000578446 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 PRSS47A8MTI9 375 aa7.31□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 UBE2L6O14933 153 aa7.31□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 Q8N8P6 123 aa7.31□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.31□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 TENM2Q9NT68 2774 aa7.3□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 SIVA1O15304 175 aa7.3□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 PKIAP61925 76 aa7.3□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 FA2HQ7L5A8 372 aa7.3□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.3□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 A0A087WX48 190 aa7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 TMEM262E9PQX1 116 aa7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 GAGE6Q13070 117 aa7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 Q9H8V8 135 aa7.29□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 LCE6AA0A183 80 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 K7EMI3 77 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IGHV3-30P01768 117 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IGHV3-33P01772 117 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 NIT1Q86X76 327 aa7.28□□□□□ -1.24
USP22-208ENST00000578446 ESDP10768 282 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 RAB5BP61020 215 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 LAGE3Q14657 143 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 MPV17L2Q567V2 206 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 TTC32Q5I0X7 151 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 BAGE3Q86Y29 109 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 Q8N3U1 123 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 TMEM18Q96B42 140 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.27□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 H7C423 109 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 LINC00614P0C842 121 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 FGF6P10767 208 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 RBX1P62877 108 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.26□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BKO60814 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BJP06899 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BOP23527 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 G0S2P27469 103 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BBP33778 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BDP58876 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BCP62807 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 Q0VG73 95 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 Q8N976 141 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 TMEM101Q96IK0 257 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.25□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 LINC01546A6NGU7 62 aa7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 K7EP13 123 aa7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 M0R2N4 97 aa7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 LYSTQ99698 3801 aa7.24□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 A0A1B0GUV1 79 aa7.23□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HSBP1O75506 76 aa7.23□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 SERF1AO75920 110 aa7.23□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.23□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.23□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 KLK12Q9UKR0 248 aa7.23□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.23□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 HBDP02042 147 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 CRPP02741 224 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 PMCHL1Q16048 86 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 TOMM6Q96B49 74 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.22□□□□□ -1.25
USP22-208ENST00000578446 LINC01549A6NIU2 74 aa7.21□□□□□ -1.26
USP22-208ENST00000578446 Q6ZUT4 128 aa7.21□□□□□ -1.26
USP22-208ENST00000578446 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.21□□□□□ -1.26
USP22-208ENST00000578446 UBE2WQ96B02 151 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms