RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551549.1

GCN1-208, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 2

Gene GCN1, Length 258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-208	ENST00000551549	NIT2	Q9NQR4	276 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	REG3A	Q06141	175 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1B0GUV1	79 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	AMT	P48728	403 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	CEBPG	P53567	150 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	BLOC1S1	P78537	153 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	COTL1	Q14019	142 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM250	H0YL14	139 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	PANO1	I0J062	215 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549		J3QL48	77 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	UBE2L6	O14933	153 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	hDV102S1	A0JD36	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549		A8MWL6	223 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	SLPI	P03973	132 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	LINC01551	Q86U37	167 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	NCR2	O95944	276 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	APCS	P02743	223 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	CT83	Q5H943	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1B0GVG6	124 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	HIGD1C	A8MV81	97 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	FGF6	P10767	208 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	PMCH	P20382	165 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	TEX261	Q6UWH6	196 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	C15orf56	Q8N910	161 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	TSKU	Q8WUA8	353 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	RNF185	Q96GF1	192 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	FAM210A	Q96ND0	272 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GCN1-208	ENST00000551549	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1B0GUT8	65 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF727	A8MUV8	499 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549		I3L3M4	83 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	TSHB	P01222	138 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	CHTF8	P0CG12	524 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	BORCS7	Q96B45	105 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	OSTC	Q9NRP0	149 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549		C9JQL5	133 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	SMKR1	H3BMG3	65 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549		H7C423	109 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	RAB4A	P20338	218 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	CFAP161	Q6P656	301 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	DPH3	Q96FX2	82 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549		V9GYV3	84 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	ESD	P10768	282 aa		6.19	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	FOXI1	Q12951	378 aa		6.19	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	NUP35	Q8NFH5	326 aa		6.19	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		6.19	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549		A0A087WYN8	130 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	OXT	P01178	125 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42

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