RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 CST9LP1Q5W188 147 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 DIRC1Q969H9 104 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 NIT2Q9NQR4 276 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 MUC2Q02817 5179 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 PTTG1IPP53801 180 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 DEFA3P59666 94 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 ISOC2Q96AB3 205 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-228ENST00000551473 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 H7C423 109 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 TRGC1P0CF51 173 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 SYCNQ0VAF6 134 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 FOXI1Q12951 378 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 C1orf137Q5JT78 98 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 BAGE2Q86Y30 109 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 UPK1BO75841 260 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 GAGE2BQ13066 116 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 MLST8Q9BVC4 326 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 NCR2O95944 276 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 FGF6P10767 208 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 TSKUQ8WUA8 353 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 TPPP3Q9BW30 176 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 PFDN1O60925 122 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 XCL1P47992 114 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 BTF3L4Q96K17 158 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 XKRY2A2RUG3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 F2Z2F3 143 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 H0Y9J4 135 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 APCSP02743 223 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 IGLV7-43P04211 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 IGLC6P0CF74 106 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 CAMPP49913 170 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 UBE2D1P51668 147 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 TMEM101Q96IK0 257 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PNN7 141 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 CCL25O15444 150 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 PAGE4O60829 102 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 NTF3P20783 257 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 DEFA1P59665 94 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 SS18Q15532 418 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-228ENST00000551473 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 APOMO95445 188 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 MALP21145 153 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 Q6ZNX1 250 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 TMUB2Q71RG4 321 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 A0A087WZ39 114 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 BCL2P10415 239 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 IFITM3Q01628 133 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 NUP35Q8NFH5 326 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 FAM210AQ96ND0 272 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 TEX261Q6UWH6 196 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 C2orf48Q96LS8 159 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 IFNA1P01562 189 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 RNF151Q2KHN1 245 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 GATD1Q8NB37 220 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 SMIM12Q96EX1 92 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 ALG5Q9Y673 324 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 I3L3M4 83 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 COX7A2LO14548 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 209.8 ms