RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	GNG4	P50150	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	RAB5C	P51148	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853		F2Z2F3	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	PDE6D	O43924	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	GZMB	P10144	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	RBX1	P62877	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	CACNG7	P62955	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	CCL20	P78556	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853		M0QY20	66 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2L6	O14933	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	REG3A	Q06141	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	PRSS1	P07477	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	NTF3	P20783	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	FAT1	Q14517	4588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	SULT1A2	P50226	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	COTL1	Q14019	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TWIST1	Q15672	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	HERC1	Q15751	4861 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1B0GUV1	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	OXT	P01178	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	BCL2	P10415	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	AMT	P48728	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	CTRL	P40313	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	CEBPG	P53567	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-238	ENST00000493853		A8MWL6	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	APCS	P02743	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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