RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 NMSQ5H8A3 153 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMG4Q5JS54 123 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A7AQ86SG5 101 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX29P2Q8IUI4 249 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 BAP18Q8IXM2 172 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC20Q8TCA0 184 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AQP10Q96PS8 301 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HIGD2AQ9BW72 106 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FXYD6Q9H0Q3 95 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MED28Q9H204 178 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNIP2Q9NS61 270 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RABAC1Q9UI14 185 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PRNDQ9UKY0 176 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa1.34□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa1.34□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0J9YX75 114 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GU33 70 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PGPA6NDG6 321 aa1.34□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 F5H768 121 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LECT2O14960 151 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PSCAO43653 123 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PMP2P02689 132 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB130BP0DP73 79 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB130AP0DP74 79 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A11P31949 105 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB5CP51148 216 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HBG1P69891 147 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HBG2P69892 147 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SERF2P84101 59 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PRCDQ00LT1 54 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R1AQ13522 171 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SMCO1Q147U7 214 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM78BQ5VT40 261 aa1.34□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZTI0 123 aa1.34□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR51H1Q8NH63 302 aa1.34□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C2orf50Q96LR7 162 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TXNDC17Q9BRA2 123 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TCEAL7Q9BRU2 100 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SMDT1Q9H4I9 107 aa1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NAGKQ9UJ70 344 aa1.34□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa1.33□□□□□ -2.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 MPC2O95563 127 aa1.33□□□□□ -2.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 FABP1P07148 127 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLC1P0CG04 106 aa1.33□□□□□ -2.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 SULT1A1P50225 295 aa1.33□□□□□ -2.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 H2BFSP57053 126 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ERHP84090 104 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 VAMP3Q15836 100 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SPINK13Q1W4C9 94 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 Q56UQ5 140 aa1.33□□□□□ -2.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 LYZL2Q7Z4W2 148 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TMED4Q7Z7H5 227 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC51BQ86UW2 128 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 STX12Q86Y82 276 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNRGQ8N5I3 272 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 GATD1Q8NB37 220 aa1.33□□□□□ -2.2
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