RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PSCA	O43653	123 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	COTL1	Q14019	142 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RHEB	Q15382	184 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.56	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PMCH	P20382	165 aa		11.55	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CKS2	P33552	79 aa		11.55	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NIT1	Q86X76	327 aa		11.55	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.55	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GXF2	115 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424		I3L3M4	83 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2L6	O14933	153 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NCR2	O95944	276 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PPBP	P02775	128 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SVBP	Q8N300	66 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		11.54	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAPIN	O95295	136 aa		11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	APOC3	P02656	99 aa		11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GCSH	P23434	173 aa		11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	AMT	P48728	403 aa		11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.53	□□□□□ -0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RMI2	Q96E14	147 aa		11.52	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	VCY	O14598	125 aa		11.51	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.51	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.51	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	APCS	P02743	223 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	XG	P55808	180 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N814	137 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TCAP	O15273	167 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	FCER1G	P30273	86 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424		Q0VG73	95 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE6	Q13070	117 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	COX19	Q49B96	90 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424		Q9HAA7	133 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PHOX2A	O14813	284 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CRP	P02741	224 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424		D6R8Y8	96 aa		11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C423	109 aa		11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	NRAC	Q8N912	160 aa		11.47	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.46	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.46	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.46	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.46	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		11.46	□□□□□ -0.57
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GUV1	79 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	EPM2A	B3EWF7	344 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	RBX1	P62877	108 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DQA1	P01909	254 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N3U1	123 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N976	141 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM18	Q96B42	140 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TSHB	P01222	138 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	MT-ND6	P03923	174 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB5A	P20339	215 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NPY	P01303	97 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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