RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 GAS8-AS1O95177 125 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 NUDT3O95989 172 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 Q0VG73 95 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 COTL1Q14019 142 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 Q8N8P6 123 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 PKIAP61925 76 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 APLNQ9ULZ1 77 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 LINC01546A6NGU7 62 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 H7C423 109 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 FCER1GP30273 86 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 CCL18P55774 89 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 Q9UF83 564 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 IQCJQ1A5X6 159 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 LELP1Q5T871 98 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 FA2HQ7L5A8 372 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 TMEM18Q96B42 140 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BKO60814 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BJP06899 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 LINC00614P0C842 121 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BOP23527 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BBP33778 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BDP58876 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BCP62807 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 LAGE3Q14657 143 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 TSHBP01222 138 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 AMTP48728 403 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 NIT1Q86X76 327 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 BAGE3Q86Y29 109 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 ESDP10768 282 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 ESRGQ1W209 222 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 UPK3BQ9BT76 320 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 TMEM243Q9BU79 118 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 K7EP13 123 aa8.05□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 NPSP0C0P6 89 aa8.05□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.05□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 UBE2L6O14933 153 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GUV1 79 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 HSBP1O75506 76 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NISCH-211ENST00000488243 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 S100A6P06703 90 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 SERF1AO75920 110 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 HBDP02042 147 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA6P56556 154 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 TOMM6Q96B49 74 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 TMEM101Q96IK0 257 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WX48 190 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 SIVA1O15304 175 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 LINC01556Q5JQF7 62 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 TMEM141Q96I45 108 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 TIMM17AQ99595 171 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 TMEM262E9PQX1 116 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 FGF6P10767 208 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 ERASQ7Z444 233 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms