RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMUB2Q71RG4 321 aa8.81□□□□□ -1
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SDCCAG3-211ENST00000486441 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.66□□□□□ -1.02
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMIM12Q96EX1 92 aa8.66□□□□□ -1.02
SDCCAG3-211ENST00000486441 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.65□□□□□ -1.02
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SDCCAG3-211ENST00000486441 MUC17Q685J3 4493 aa8.63□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.63□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.63□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 BCL2P10415 239 aa8.63□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.62□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 HMSDA8MTL9 139 aa8.62□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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