RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 Q8N814 137 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 CRPP02741 224 aa13.86□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 AMTP48728 403 aa13.86□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 MRAP2Q96G30 205 aa13.86□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 PRR34Q9NV39 138 aa13.86□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GUV1 79 aa13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 CDK2AP2O75956 126 aa13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 NCR2O95944 276 aa13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 CAMPP49913 170 aa13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 BAALCQ8WXS3 180 aa13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 ST20Q9HBF5 79 aa13.85□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GW15 77 aa13.84□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 SMKR1H3BMG3 65 aa13.84□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 LECT2O14960 151 aa13.84□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.84□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 LINC00269Q8N2A0 174 aa13.84□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.84□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 HSPG2P98160 4391 aa13.83□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 I3L3M4 83 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R2P9O14990 202 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 MIAQ16674 131 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GXF2 115 aa13.82□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 UBE2L6O14933 153 aa13.82□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 PMCHP20382 165 aa13.82□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 UQCC3Q6UW78 93 aa13.82□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.81□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 APCSP02743 223 aa13.81□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-1P60331 282 aa13.81□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.81□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 NRACQ8N912 160 aa13.81□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 TSHBP01222 138 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 MT-ND4LP03901 98 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 ADCYAP1P18509 176 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 GCSHP23434 173 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 HBBP68871 147 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 REG3AQ06141 175 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC16Q96DE5 110 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 TMEM218A2RU14 115 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 H7C423 109 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R17O96001 155 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 S100A8P05109 93 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-211ENST00000480301 LINC00862A6NCI5 91 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 ESDP10768 282 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 VCYO14598 125 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 F8W036 122 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 FGF6P10767 208 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 CKS2P33552 79 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 COMMD7Q86VX2 200 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 DNAH8Q96JB1 4490 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DQA1P01909 254 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 C20orf78Q9BR46 151 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 D6R8Y8 96 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 XGP55808 180 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 SEC11CQ9BY50 192 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 USP17L23D6RBM5 183 aa13.71□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF6BO95407 300 aa13.71□□□□□ -0.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 FCER1GP30273 86 aa13.7□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 C7orf77A4D0Y5 90 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 PPBPP02775 128 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 C14orf177Q52M58 125 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DL4Q99706 377 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 NPYP01303 97 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 TMEM101Q96IK0 257 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 BTF3L4Q96K17 158 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 IMMP2LQ96T52 175 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 PHOX2AO14813 284 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 C10orf91Q5T1B1 145 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 CTDSP1Q9GZU7 261 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTB-211ENST00000480301 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.67□□□□□ -0.22
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