RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817		A8MWL6	223 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	PRSS1	P07477	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	COTL1	Q14019	142 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	MYCBP2	O75592	4640 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A1B0GVG6	124 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	AMT	P48728	403 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	CT83	Q5H943	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	HERC1	Q15751	4861 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	UBE2L6	O14933	153 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CTBP2-208	ENST00000476817	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	NCR2	O95944	276 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A1B0GUT8	65 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	GAS8-AS1	O95177	125 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	APCS	P02743	223 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP2-208	ENST00000476817	hDV102S1	A0JD36	115 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817		H7C423	109 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817		I3L3M4	83 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	RNF185	Q96GF1	192 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817		V9GYV3	84 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	PMCH	P20382	165 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	FGF6	P10767	208 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	RAB4A	P20338	218 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817		C9JQL5	133 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	SLPI	P03973	132 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	ST20	Q9HBF5	79 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	PANO1	I0J062	215 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	AMN1	Q8IY45	258 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	TSHB	P01222	138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	ESD	P10768	282 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	RIG	Q13278	110 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	MRAP2	Q96G30	205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	C15orf56	Q8N910	161 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	ADIRF	Q15847	76 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817		J3QL48	77 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	CFAP161	Q6P656	301 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	SMKR1	H3BMG3	65 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	PEA15	Q15121	130 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM101	Q96IK0	257 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	BTF3L4	Q96K17	158 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CTBP2-208	ENST00000476817	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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