RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAGE2BQ13066 116 aa9.98□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.98□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RASL11AQ6T310 242 aa9.98□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.97□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2D1P51668 147 aa9.97□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFA3P59666 94 aa9.97□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.97□□□□□ -0.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.96□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISOC2Q96AB3 205 aa9.96□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.96□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NIT2Q9NQR4 276 aa9.96□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FGF6P10767 208 aa9.95□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKR1C3P42330 323 aa9.95□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ENKURQ8TC29 256 aa9.95□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSNA1O43805 119 aa9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XCL1P47992 114 aa9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FHITP49789 147 aa9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF726P1Q15940 193 aa9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STOML3Q8TAV4 291 aa9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.93□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H7C423 109 aa9.92□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.92□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMPP49913 170 aa9.92□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.92□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSKUQ8WUA8 353 aa9.92□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.91□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL25O15444 150 aa9.91□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CST9LP1Q5W188 147 aa9.9□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLST8Q9BVC4 326 aa9.9□□□□□ -0.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087WZ39 114 aa9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOMO95445 188 aa9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL2P10415 239 aa9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAGE2Q86Y30 109 aa9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPPP3Q9BW30 176 aa9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.88□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCR2O95944 276 aa9.88□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRGC1P0CF51 173 aa9.88□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTF3P20783 257 aa9.87□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SS18Q15532 418 aa9.87□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.87□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP35Q8NFH5 326 aa9.87□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTF3L4Q96K17 158 aa9.87□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.86□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM101Q96IK0 257 aa9.86□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.86□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.86□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPAN13O95857 204 aa9.85□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APCSP02743 223 aa9.85□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLC6P0CF74 106 aa9.85□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.85□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.84□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZNX1 250 aa9.84□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.84□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.84□□□□□ -0.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F2Z2F3 143 aa9.83□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MALP21145 153 aa9.83□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.83□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2orf48Q96LS8 159 aa9.82□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAGE4O60829 102 aa9.81□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF151Q2KHN1 245 aa9.81□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.8□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XKRY2A2RUG3 117 aa9.8□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDIP1Q9H305 208 aa9.8□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX7A2LO14548 114 aa9.79□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL2L11O43521 198 aa9.79□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PFDN1O60925 122 aa9.79□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ESDP10768 282 aa9.79□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.79□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GATD1Q8NB37 220 aa9.79□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.78□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMUB2Q71RG4 321 aa9.78□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100ZQ8WXG8 99 aa9.78□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UPK1BO75841 260 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IMMP2LQ96T52 175 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 I3L3M4 83 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms