RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD12-201ENST00000404162 COTL1Q14019 142 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NIT2Q9NQR4 276 aa11.7□□□□□ -0.54
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HOXD12-201ENST00000404162 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.68□□□□□ -0.54
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HOXD12-201ENST00000404162 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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HOXD12-201ENST00000404162 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXD12-201ENST00000404162 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.64□□□□□ -0.55
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HOXD12-201ENST00000404162 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.63□□□□□ -0.55
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HOXD12-201ENST00000404162 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.53□□□□□ -0.56
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HOXD12-201ENST00000404162 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.52□□□□□ -0.57
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HOXD12-201ENST00000404162 MBD3L1Q8WWY6 194 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN13O95857 204 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CENPWQ5EE01 88 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 BCL2L11O43521 198 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 IFNA1P01562 189 aa11.48□□□□□ -0.57
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HOXD12-201ENST00000404162 MALP21145 153 aa11.48□□□□□ -0.57
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