RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PAEPP09466 180 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 G0S2P27469 103 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM244Q5VVB8 128 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LYSTQ99698 3801 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RYR1P21817 5038 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.94□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 MYH8P13535 1937 aa-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 CCDC179H3BU77 68 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 M0R135 149 aa-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 RBP4P02753 201 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PIRTP0C851 137 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SMIM6P0DI80 62 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HLA-DRB4P13762 266 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CCL18P55774 89 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.95□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 RPRMQ9NS64 109 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MRC1P22897 1456 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRDM2Q13029 1718 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZZEF1O43149 2961 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM238C9JI98 176 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SMIM24O75264 130 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DPM2O94777 84 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM107AO95990 144 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PPP1R17O96001 155 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 S100A3P33764 101 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.97□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.97□□□□□ -2.56
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 BOLA2Q9H3K6 86 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.97□□□□□ -2.57
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 A6NIN4 97 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GNG10P50151 68 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SAMD13Q5VXD3 122 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DEFB123Q8N688 67 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-0.98□□□□□ -2.57
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RNU6-1175P-201ENST00000365200 TNFSF15O95150 251 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CMPK1P30085 196 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM128Q5BJH2 165 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 REV3LO60673 3130 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LRRC37A3O60309 1634 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 H0YJX3 145 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFNA17P01571 189 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HIGD1AQ9Y241 93 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 R4GMQ9 66 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 V9GYH0 126 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NSD3Q9BZ95 1437 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GAPVD1Q14C86 1478 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1175P-201ENST00000365200 YPEL1O60688 119 aa-1.01□□□□□ -2.57
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