RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERPINA1P01009 418 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOEP02649 317 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOC3P02656 99 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARL5BQ96KC2 179 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00470Q9BZP3 86 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS18Q9NS28 235 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRBV19A0A075B6N1 114 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GX78 115 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARPC3O15145 178 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GYPCP04921 128 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAT1P21673 171 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YWHAQP27348 245 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL35P42766 123 aaKnown RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASP4P49662 377 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MREGQ8N565 214 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSGA13Q96PP4 275 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IDI2Q9BXS1 227 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ORC6Q9Y5N6 252 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLTCL1P53675 1640 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COX7A2LO14548 114 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CST8O60676 142 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DCTDP32321 178 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRIP1P50238 77 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C21orf59P57076 290 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB5BP61020 215 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKIAP61925 76 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MXD1Q05195 221 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACBD7Q8N6N7 88 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPACA7Q96KW9 195 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLIC4Q9Y696 253 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 R4GMQ9 66 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 I3L4J1 428 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0QZK8 103 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRYZL1O95825 349 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RALAP11233 206 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXCL2P19875 107 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSN1S1P47710 185 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB10P61026 200 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1DQ13901 141 aaKnown RBP-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHOHQ15669 191 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFAP58Q5T655 872 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPATA1Q5VX52 437 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC25Q86WR0 208 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CIB1Q99828 191 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IQGAP2Q13576 1575 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MROH2BQ7Z745 1585 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP162Q5TB80 1403 aa-5.47□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC30A6NM36 301 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UQCRQO14949 82 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSTM1P09488 218 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSX2Q16385 188 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEC11CQ9BY50 192 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H1F0P07305 194 aaKnown RBP-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRBOX4Q5JUW0 171 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYCE1Q8N0S2 351 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFI27L1Q96BM0 104 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAGR1Q9BTK6 254 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDHAF2Q9NX18 166 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C7orf71A4D174 169 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS5O15539 181 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SETSIPP0DME0 302 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPS18P62269 152 aaKnown RBP-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A12P80511 92 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXN4Q5MJ08 99 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SFTA2Q6UW10 78 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C8orf76Q96K31 380 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PBDC1Q9BVG4 233 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CALN1Q9BXU9 219 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTTY13Q9BZ97 58 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NMES1Q9C002 83 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB6BQ9NRW1 208 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CKLFQ9UBR5 152 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-5.5□□□□□ -3.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBP4P02753 201 aa-5.5□□□□□ -3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.4 ms