RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 YPEL4Q96NS1 127 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM89A2RUT3 159 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 C17orf77Q96MU5 243 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 EPOPA6NHQ4 379 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 M0QXV9 152 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 CTSGP08311 255 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 SPAG11BQ08648 103 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.33□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-33P01772 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 NCR3O14931 201 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-30P01768 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00694P0DN24 101 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0J9YX75 114 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 MIFP14174 115 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 Q9HAA7 133 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.32□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0J9YY99 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM223A0PJW6 202 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 NRACQ8N912 160 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 COX17Q14061 63 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZQT7 251 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 PRO0628Q9UI54 55 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 MLST8Q9BVC4 326 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 K7ENP7 123 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 PIEZO1Q92508 2521 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 GPHB5Q86YW7 130 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 P0C879 139 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 XGP55808 180 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 PATE2Q6UY27 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.3□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 ZMAT4Q9H898 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 LTBP2Q14767 1821 aa6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 UBE2D2P62837 147 aa6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 RETNQ9HD89 108 aa6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.29□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 CCL18P55774 89 aa6.28□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 Q8N9L7 120 aa6.28□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 LYPD6Q86Y78 171 aa6.28□□□□□ -1.4
PKHD1-201ENST00000340994 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087WW49 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 CCKP06307 115 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 MBD6Q96DN6 1003 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 CCL24O00175 119 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV2-14P01704 120 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV2-23P01705 113 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 NRGNQ92686 78 aa6.27□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.26□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 PRORYQ9H606 182 aa6.26□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 SNURFQ9Y675 71 aa6.26□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.26□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.26□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV2-8P01709 118 aa6.26□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF524Q96C55 264 aa6.26□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.25□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 POLQO75417 2590 aa6.25□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 ARTNQ5T4W7 220 aa6.25□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 PROK2Q9HC23 129 aa6.25□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 A0A096LPF7 62 aa6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 CNFNQ9BYD5 112 aa6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.24□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.23□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.23□□□□□ -1.41
PKHD1-201ENST00000340994 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
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