RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 MUC4Q99102 2169 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 H3BMM0 161 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 SOCS3O14543 225 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 KLLNB2CW77 178 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 C9JAW5 83 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE6Q13070 117 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 PTH2Q96A98 100 aa9.29□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM238C9JI98 176 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 E9PLD3 99 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZSV7 163 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 M0QY20 66 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB4AO15263 64 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 FBN2P35556 2912 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 A4D1N5 150 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.28□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 CRYGDP07320 174 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 SMR3AQ99954 134 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZTI0 123 aa9.27□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 TEX29Q8N6K0 151 aa9.26□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.26□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 Q9UF83 564 aa9.26□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF580Q9UK33 172 aa9.26□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.26□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.25□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZUT4 128 aa9.25□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 HIGD1BQ9P298 99 aa9.25□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 RHODO00212 210 aa9.25□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.25□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 J3QKU1 62 aa9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 MED14OSP0DP75 135 aa9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00158P58513 81 aa9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 RHOHQ15669 191 aa9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 ITPR2Q14571 2701 aa9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 PFN2P35080 140 aa9.24□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 RBX1P62877 108 aa9.23□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 TIMM17AQ99595 171 aa9.23□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 F8P00451 2351 aa9.23□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0J9YY99 117 aa9.23□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 SIGMAR1Q99720 223 aa9.23□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.23□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 TAL2Q16559 108 aa9.22□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.22□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.22□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 Q9H8V8 135 aa9.22□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.21□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFA7O95182 113 aa9.21□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 PLA2G2AP14555 144 aa9.21□□□□□ -0.93
UBXN4-201ENST00000272638 TSHBP01222 138 aa9.21□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.21□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 C5orf38Q86SI9 138 aa9.21□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.21□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 LGALS9O00182 355 aa9.21□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TM2D2Q9BX73 214 aa9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZSN1 163 aa9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 C9orf85Q96MD7 179 aa9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF575Q86XF7 245 aa9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.2□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM89A2RUT3 159 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 F8W1H4 67 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 LEPROTO15243 131 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 IGIPA6NJ69 53 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 NXPH4O95158 308 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TSPAN13O95857 204 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM243Q9BU79 118 aa9.19□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 CFC1BP0CG36 223 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 CFC1P0CG37 223 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 ZMAT4Q9H898 229 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 PAX4O43316 350 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 C2orf82Q6UX34 121 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 INSL3P51460 131 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.18□□□□□ -0.94
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.7 ms