RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 DCANP1Q8TF63 244 aa15.05■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.04■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A20O43772 301 aa15.03■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.03■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa15.03■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 C20orf173Q96LM9 149 aa15.03■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 C9JAW5 83 aa15.03■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa15.03■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.02■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.02■□□□□ -0
UBE2B-201ENST00000265339 ASIPP42127 132 aa15.02□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.02□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZQT7 251 aa15.02□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 CFC1BP0CG36 223 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 CFC1P0CG37 223 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 RASL10AQ92737 203 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM2Q9BVW6 85 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf126Q8N4M7 172 aa15□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 BAALCQ8WXS3 180 aa15□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 RBAKDNA6NC62 111 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 K7EQG2 157 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 TOMM6Q96B49 74 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 VWFP04275 2813 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0J9YY99 117 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 C3orf56Q8N813 242 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 ID1P41134 155 aa14.97□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB1P60022 68 aa14.97□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.97□□□□□ -0.01
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-30P01768 117 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 EMP1P54849 157 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 Q8N1Y9 231 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 H7C2G1 150 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV1-51P01701 117 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 STAB1Q9NY15 2570 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 F6UB75 175 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 Q6Q795 121 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 J3KRW8 73 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 SPRY2O43597 315 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 ODF3Q96PU9 254 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 COL6A5A8TX70 2615 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf86A6NJI1 115 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 HERVK_113P61574 105 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 PRR9Q5T870 116 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 SORL1Q92673 2214 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE2B-201ENST00000265339 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.89□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 M0QXV9 152 aa14.89□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.89□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.89□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB131AP59861 70 aa14.88□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.88□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.88□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 CRYGDP07320 174 aa14.88□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 A4D1N5 150 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 M0R381 172 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-33P01772 117 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 Q1RN00 199 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0J9YX75 114 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 LINC01620Q4KN68 170 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00477Q96M19 166 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 MGPP08493 103 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN8Q156A1 80 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 MDFICQ9P1T7 246 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2B-201ENST00000265339 KNCNA6PVL3 124 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-201ENST00000265339 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-201ENST00000265339 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-201ENST00000265339 MDFIQ99750 246 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2B-201ENST00000265339 H3BMM0 161 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms