RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.18□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 I3L3M4 83 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 NDPQ00604 133 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PEMTQ9UBM1 199 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PKDREJQ9NTG1 2253 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 A0A0J9YX75 114 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 TACC2O95359 2948 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 NPC2P61916 151 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 LITAFQ99732 161 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13.15□□□□□ -0.3
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GLIS1-202ENST00000628545 SERP2Q8N6R1 65 aa13.14□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 VCYO14598 125 aa13.14□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 PFN2P35080 140 aa13.13□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 FAM27E3Q08E93 113 aa13.13□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.13□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 NUP37Q8NFH4 326 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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GLIS1-202ENST00000628545 GNRH2O43555 120 aa13.12□□□□□ -0.31
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GLIS1-202ENST00000628545 MGAQ8IWI9 3026 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087WW49 117 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00315P59091 139 aa13.11□□□□□ -0.31
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GLIS1-202ENST00000628545 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.11□□□□□ -0.31
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GLIS1-202ENST00000628545 POLEQ07864 2286 aa13.1□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.1□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.1□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV1-69P01742 117 aa13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 F5H697 171 aa13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 C16orf92Q96LL3 132 aa13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-202ENST00000628545 EDN2P20800 178 aa13.08□□□□□ -0.31
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GLIS1-202ENST00000628545 APC2O95996 2303 aa13.08□□□□□ -0.32
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GLIS1-202ENST00000628545 A0A087WWL8 130 aa13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.08□□□□□ -0.32
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GLIS1-202ENST00000628545 MIAQ16674 131 aa13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
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GLIS1-202ENST00000628545 C15orf32Q32M92 178 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM86BQ8N661 226 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 FDCSPQ8NFU4 85 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 C20orf173Q96LM9 149 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DYNLRB1Q9NP97 96 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 TIRAPP58753 221 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB1P60022 68 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DAND5Q8N907 189 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DPM3Q9P2X0 92 aa13.05□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 RS1O15537 224 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 C9orf85Q96MD7 179 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 ATMQ13315 3056 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 ACACAQ13085 2346 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 SYNJ2BPP57105 145 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 FHL2Q14192 279 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA4P78363 2273 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 NXPH4O95158 308 aa13.03□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 CLEC19AQ6UXS0 136 aa13.03□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 BSPH1Q075Z2 132 aa13.03□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.02□□□□□ -0.33
GLIS1-202ENST00000628545 C22orf24Q9Y442 160 aa13.02□□□□□ -0.33
GLIS1-202ENST00000628545 NACAE9PAV3 2078 aa13.02□□□□□ -0.33
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa13.02□□□□□ -0.33
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