RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 C5orf47Q569G3 176 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 Q6ZS46 218 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 MBD6Q96DN6 1003 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TIMM21Q9BVV7 248 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 AVPP01185 164 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 CRYGBP07316 175 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 GHRHP01286 108 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 CRPP02741 224 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 C3orf56Q8N813 242 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 NPBQ8NG41 125 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 ITPR1Q14643 2758 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 K7EMI3 77 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 MLST8Q9BVC4 326 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 CRIP1P50238 77 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 GATD1Q8NB37 220 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 SPXQ9BT56 116 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 ZNF876PQ49A33 203 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TMEM141Q96I45 108 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 SOCS3O14543 225 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 OVOL1O14753 267 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 BUB3O43684 328 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 LY6LH3BQJ8 138 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 J3QQQ9 107 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 GNRH2O43555 120 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 DEFB131AP59861 70 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 PTH2Q96A98 100 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 ODF3BA8MYP8 253 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 E9PLD3 99 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 IGF1P05019 195 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 GATA3P23771 443 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 AJUBAQ96IF1 538 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 MAST4O15021 2626 aa6.96□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 ATOX1O00244 68 aa6.96□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 Q6ZQT7 251 aa6.96□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 USMG5Q96IX5 58 aa6.96□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 LINC01587Q99440 93 aa6.96□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 LINC01620Q4KN68 170 aa6.96□□□□□ -1.3
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GGA3-222ENST00000621217 KNCNA6PVL3 124 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 MYCNOSP40205 109 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 FAM223BA6NKX1 122 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 SLURP1P55000 103 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 ZNF415Q09FC8 603 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 SPATA25Q9BR10 227 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 A0A1B0GXF2 115 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 RASL10AQ92737 203 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 CCDC140Q96MF4 163 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 ZANQ9Y493 2812 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 LEPROTO15243 131 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 IGLV2-11P01706 119 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 TMEM86BQ8N661 226 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 LINC00158P58513 81 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 GAS8-AS1O95177 125 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 XCL2Q9UBD3 114 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 TMEM258P61165 79 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 MRAPQ8TCY5 172 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 PAX4O43316 350 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 IGHV3-53P01767 116 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 SMR3AQ99954 134 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 UBL5Q9BZL1 73 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 PEMTQ9UBM1 199 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-222ENST00000621217 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.93□□□□□ -1.3
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