RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 NKAPP1Q8N9T2 125 aa15.73■□□□□ 0.11
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PTPRJ-208ENST00000615445 Q6YL49 198 aa15.72■□□□□ 0.11
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PTPRJ-208ENST00000615445 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-208ENST00000615445 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa15.56■□□□□ 0.08
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PTPRJ-208ENST00000615445 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CCL18P55774 89 aa15.55■□□□□ 0.08
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