RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590843.1

SEH1L-208, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 5,206 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-208ENST00000590843 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF479Q96JC4 524 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 C17orf77Q96MU5 243 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 A0A1B0GVG6 124 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 SYCNQ0VAF6 134 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 Q9H8V8 135 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 RETNQ9HD89 108 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 BTCP35070 178 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 IFITM3Q01628 133 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 SMKR1H3BMG3 65 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 COX7B2Q8TF08 81 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 C11orf52Q96A22 123 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 TNCP24821 2201 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 MORN5Q5VZ52 161 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 MDFIQ99750 246 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 C9orf85Q96MD7 179 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 F8P00451 2351 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-208ENST00000590843 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 C16orf90A8MZG2 172 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 RS1O15537 224 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 UBE2D3P61077 147 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 C6orf223Q8N319 242 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 IGLC2P0DOY2 106 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 Q6ZTC4 211 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 DKK2Q9UBU2 259 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 NPC2P61916 151 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 Q6ZS46 218 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 Q5BKY6 102 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 REG3GQ6UW15 175 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 MDFICQ9P1T7 246 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 SORL1Q92673 2214 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 PRAC2D3DTV9 90 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 KIR3DS1Q14943 382 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 MLST8Q9BVC4 326 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 UTF1Q5T230 341 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 SPINK8P0C7L1 97 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 ESDP10768 282 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 F8WDY8 70 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 COL4A2P08572 1712 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 PRSS47A8MTI9 375 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 PATE2Q6UY27 113 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 DSCR8Q96T75 97 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.4□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.4□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.4□□□□□ -1.06
SEH1L-208ENST00000590843 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.4□□□□□ -1.07
SEH1L-208ENST00000590843 DIRC1Q969H9 104 aa8.4□□□□□ -1.07
SEH1L-208ENST00000590843 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-208ENST00000590843 E7EUB6 86 aa8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-208ENST00000590843 SERF1AO75920 110 aa8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-208ENST00000590843 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-208ENST00000590843 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-208ENST00000590843 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.39□□□□□ -1.07
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