RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GYPE	P15421	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GAGE1	Q13065	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GAGE4	Q13068	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GAGE5	Q13069	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	ZNF56	Q15929	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		A8MWV9	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		F5H697	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SNAI2	O43623	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	MAL	P21145	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		F8W036	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	CXCL1	P09341	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TIRAP	P58753	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TWIST1	Q15672	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		Q8N814	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		V9GYV3	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688		A8MWL6	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	NTF3	P20783	257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	CTRL	P40313	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	RHOH	Q15669	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	RHOD	O00212	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	OXT	P01178	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	CACNG7	P62955	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	HAMP	P81172	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	PTH2	Q96A98	100 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688		F2Z2F3	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	CIDEA	O60543	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	NCR2	O95944	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	CAMP	P49913	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	LAGE3	Q14657	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688		Q6ZSA8	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688		Q8N3U1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GUT8	65 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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