RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 COX19Q49B96 90 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 MRAP2Q96G30 205 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 K7EQD1 137 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 LINC00694P0DN24 101 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 CKS2P33552 79 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 CIDEAO60543 219 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 SRIP30626 198 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 IQCJQ1A5X6 159 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 ORMDL3Q8N138 153 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 PRELID3AQ96N28 172 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 PRO0255Q9UI72 69 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 GAGE12JA6NER3 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 PAX4O43316 350 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TNFRSF6BO95407 300 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 PPBPP02775 128 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 GYPEP15421 78 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 GAGE1Q13065 139 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 GAGE4Q13068 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 GAGE5Q13069 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 RHOHQ15669 191 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 GAGE13Q4V321 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 NIT2Q9NQR4 276 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 A0A096LPF7 62 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 H7C1H1 209 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 UBE2D3P61077 147 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 UBE2D2P62837 147 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BKO60814 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BJP06899 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BOP23527 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BBP33778 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BDP58876 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 LINC00310P59036 64 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BCP62807 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-216ENST00000549221 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 IGLL5B9A064 214 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 C20orf78Q9BR46 151 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 ST20Q9HBF5 79 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 PRSS47A8MTI9 375 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 H3BNG1 76 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 TCAPO15273 167 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 NUPR1O60356 82 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 NUDT3O95989 172 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 TSHBP01222 138 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 LYSTQ99698 3801 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 PPP1R17O96001 155 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 Q0VG73 95 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 MUC7Q8TAX7 377 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 APLNQ9ULZ1 77 aa5.62□□□□□ -1.51
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