RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 KIR2DL4Q99706 377 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 GAGE12BA1L429 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DEFB4AO15263 64 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 GAGE7O76087 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 GAGE12FP0CL80 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 GAGE12GP0CL81 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 GAGE12IP0CL82 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ZNF479Q96JC4 524 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 SPXQ9BT56 116 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DEFB135Q30KP9 77 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 PET117Q6UWS5 81 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DKK2Q9UBU2 259 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 VCYO14598 125 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DEFB130BP0DP73 79 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DEFB130AP0DP74 79 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 PRSS47A8MTI9 375 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 STPG4Q8N801 248 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 H7C1H1 209 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DEFA6Q01524 100 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 LINC01545Q5VT33 79 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 Q6ZN92 141 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 C16orf74Q96GX8 76 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 LINC01546A6NGU7 62 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ATP5LO75964 103 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 RHODO00212 210 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 I3L3M4 83 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TOMM6Q96B49 74 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 RS1O15537 224 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 IGLC3P0DOY3 106 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 ODF1Q14990 250 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 OR11H2Q8NH07 326 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-11P60412 298 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 BATFQ16520 125 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 GAGE12JA6NER3 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 G3V4G9 280 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 TSHBP01222 138 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 GAGE1Q13065 139 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 GAGE4Q13068 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 GAGE5Q13069 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 GAGE13Q4V321 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 ERASQ7Z444 233 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 IL17DQ8TAD2 202 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 NMUP48645 174 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 APOC4P55056 127 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 CTAG1AP78358 180 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 X6R8D5 127 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 K7EMI3 77 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-215ENST00000549143 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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