RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM101Q96IK0 257 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIMM17AQ99595 171 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SOSTQ9BQB4 213 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 MARVELD1Q9BSK0 173 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIGD2AQ9BW72 106 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NMES1Q9C002 83 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMDT1Q9H4I9 107 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 JPT2Q9H910 190 aa0.9□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EXTL2Q9UBQ6 330 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 AP4S1Q9Y587 144 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALG5Q9Y673 324 aa0.9□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SULT1A4P0DMN0 295 aa0.89□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 HOGA1Q86XE5 327 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51S1Q8NGJ8 323 aa0.89□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C15orf40Q8WUR7 153 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEDD2Q8WXF8 326 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHB2Q96CS7 222 aa0.89□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa0.88□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf91Q5T1B1 145 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 UFSP1Q6NVU6 142 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa0.88□□□□□ -2.27
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFP82Q8N141 532 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKAPP1Q8N9T2 125 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF485Q8NCK3 441 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ORAOV1Q8WV07 137 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM80Q96HE8 168 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SFRP2Q96HF1 295 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 HYLS1Q96M11 299 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPRR4Q96PI1 79 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TP53RKQ96S44 253 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 GFI1Q99684 422 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBKSQ9H477 322 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV18A0A075B6X5 111 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS47A8MTI9 375 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 G3V3Q6 166 aa0.87□□□□□ -2.27
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