RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BUX3 64 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LY6EQ16553 131 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.42□□□□□ -1.86
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RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00643Q86TS7 51 aa3.42□□□□□ -1.86
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RABGGTB-213ENST00000496055 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.42□□□□□ -1.86
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RABGGTB-213ENST00000496055 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
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RABGGTB-213ENST00000496055 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.878e-8■□□□□ 8.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.4□□□□□ -1.87
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RABGGTB-213ENST00000496055 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
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RABGGTB-213ENST00000496055 H7BZZ5 65 aa3.38□□□□□ -1.87
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RABGGTB-213ENST00000496055 FXYD3Q14802 87 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZVQ6 151 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-213ENST00000496055 LCA10Q71F78 164 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.38□□□□□ -1.87
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