RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 IMMP2LQ96T52 175 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 NIT2Q9NQR4 276 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 GAGE12JA6NER3 117 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00694P0DN24 101 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 UBE2D3P61077 147 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 SSTP61278 116 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 UBE2D2P62837 147 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 GAGE1Q13065 139 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 GAGE4Q13068 117 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 GAGE5Q13069 117 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 GAGE13Q4V321 117 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 NFE4Q86UQ8 179 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 NUP35Q8NFH5 326 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 MRAP2Q96G30 205 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 BTF3L4Q96K17 158 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 M0QY20 66 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 ELOBQ15370 118 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 Q6ZSN1 163 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 S100PP25815 95 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00315P59091 139 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 HBBP68871 147 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 RHEBQ15382 184 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 NACAE9PAV3 2078 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 TCAPO15273 167 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 Q6ZR54 194 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 NCR2O95944 276 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 PPBPP02775 128 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 LAGE3Q14657 143 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 A0A087WX48 190 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 COX19Q49B96 90 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 SVBPQ8N300 66 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 C6orf223Q8N319 242 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 SNAPINO95295 136 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 COTL1Q14019 142 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 GATD1Q8NB37 220 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 COX11Q9Y6N1 276 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 PHOX2AO14813 284 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 RAB4AP20338 218 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 RMI2Q96E14 147 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 ST20Q9HBF5 79 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1B0GXF2 115 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 H7C423 109 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 M0R2N4 97 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 CAMPP49913 170 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 IQCJQ1A5X6 159 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 C20orf78Q9BR46 151 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 I3L3M4 83 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 UBE2L6O14933 153 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 ADCYAP1P18509 176 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 CKS2P33552 79 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 Q0VG73 95 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 TM2D2Q9BX73 214 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 VCYO14598 125 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 EREGO14944 169 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 PMCHP20382 165 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 NIT1Q86X76 327 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 AMN1Q8IY45 258 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 KIR2DL4Q99706 377 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM243Q9BU79 118 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 175.5 ms