RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 DERL1Q9BUN8 251 aa8.48□□□□□ -1.05
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SDCCAG3-210ENST00000481114 GTSF1Q8WW33 167 aa8.47□□□□□ -1.05
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SDCCAG3-210ENST00000481114 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.44□□□□□ -1.06
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SDCCAG3-210ENST00000481114 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.43□□□□□ -1.06
SDCCAG3-210ENST00000481114 AQP10Q96PS8 301 aa8.43□□□□□ -1.06
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.42□□□□□ -1.06
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SDCCAG3-210ENST00000481114 CFAP161Q6P656 301 aa8.41□□□□□ -1.06
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.4□□□□□ -1.06
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SDCCAG3-210ENST00000481114 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.4□□□□□ -1.06
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SDCCAG3-210ENST00000481114 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.4□□□□□ -1.06
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM243Q9BU79 118 aa8.4□□□□□ -1.06
SDCCAG3-210ENST00000481114 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SDCCAG3-210ENST00000481114 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.4□□□□□ -1.06
SDCCAG3-210ENST00000481114 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.39□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 MGPP08493 103 aa8.39□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR5AL1P0C617 328 aa8.39□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 SULT1A2P50226 295 aa8.39□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.39□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 AP1S3Q96PC3 154 aa8.39□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 H7C1H1 209 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 FHITP49789 147 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 DEFA1P59665 94 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 C15orf56Q8N910 161 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.38□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 M0QY20 66 aa8.37□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 UBE2L6O14933 153 aa8.37□□□□□ -1.07
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SDCCAG3-210ENST00000481114 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 BAGE2Q86Y30 109 aa8.36□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.35□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 ALG5Q9Y673 324 aa8.35□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A096LNI7 61 aa8.34□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 PAGE4O60829 102 aa8.34□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q5BKY6 102 aa8.34□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 MLST8Q9BVC4 326 aa8.34□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.34□□□□□ -1.07
SDCCAG3-210ENST00000481114 AMTP48728 403 aa8.33□□□□□ -1.08
SDCCAG3-210ENST00000481114 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
SDCCAG3-210ENST00000481114 RASL11AQ6T310 242 aa8.33□□□□□ -1.08
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZRP5 223 aa8.33□□□□□ -1.08
SDCCAG3-210ENST00000481114 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.33□□□□□ -1.08
SDCCAG3-210ENST00000481114 TPPP3Q9BW30 176 aa8.33□□□□□ -1.08
SDCCAG3-210ENST00000481114 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.32□□□□□ -1.08
SDCCAG3-210ENST00000481114 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.32□□□□□ -1.08
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