RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.01■■■■□ 3.04
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SDCCAG3-210ENST00000481114 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.53■■■□□ 2.16
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SDCCAG3-210ENST00000481114 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.98■■■□□ 2.07
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SDCCAG3-210ENST00000481114 SCRIBQ14160 1630 aa27.94■■■□□ 2.06
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SDCCAG3-210ENST00000481114 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.18■■□□□ 1.94
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SDCCAG3-210ENST00000481114 NCAPD3P42695 1498 aa26.82■■□□□ 1.88
SDCCAG3-210ENST00000481114 ERCC6Q03468 1493 aa26.8■■□□□ 1.88
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SDCCAG3-210ENST00000481114 SMARCA2P51531 1590 aa26.63■■□□□ 1.85
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMARCA4P51532 1647 aa26.61■■□□□ 1.85
SDCCAG3-210ENST00000481114 HMGXB3Q12766 1538 aa26.6■■□□□ 1.85
SDCCAG3-210ENST00000481114 NESP48681 1621 aa26.52■■□□□ 1.84
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SDCCAG3-210ENST00000481114 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.19■■□□□ 1.78
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SDCCAG3-210ENST00000481114 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.01■■□□□ 1.75
SDCCAG3-210ENST00000481114 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.94■■□□□ 1.74
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRIM41Q8WV44 630 aa25.91■■□□□ 1.74
SDCCAG3-210ENST00000481114 WIZO95785 1651 aa25.9■■□□□ 1.74
SDCCAG3-210ENST00000481114 WDR62O43379 1518 aa25.87■■□□□ 1.73
SDCCAG3-210ENST00000481114 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.79■■□□□ 1.72
SDCCAG3-210ENST00000481114 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.72■■□□□ 1.71
SDCCAG3-210ENST00000481114 CFTRP13569 1480 aa25.63■■□□□ 1.69
SDCCAG3-210ENST00000481114 OSCARQ8IYS5 282 aa25.59■■□□□ 1.69
SDCCAG3-210ENST00000481114 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SDCCAG3-210ENST00000481114 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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SDCCAG3-210ENST00000481114 PRDM2Q13029 1718 aa25.39■■□□□ 1.65
SDCCAG3-210ENST00000481114 IFT140Q96RY7 1462 aa25.28■■□□□ 1.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.25■■□□□ 1.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 TOPBP1Q92547 1522 aa25.2■■□□□ 1.62
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARHGEF11O15085 1522 aa25.14■■□□□ 1.62
SDCCAG3-210ENST00000481114 ABCC8Q09428 1581 aa25.13■■□□□ 1.61
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SDCCAG3-210ENST00000481114 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.02■■□□□ 1.6
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SDCCAG3-210ENST00000481114 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SDCCAG3-210ENST00000481114 FBLN2P98095 1184 aa24.96■■□□□ 1.59
SDCCAG3-210ENST00000481114 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARAP1Q96P48 1450 aa24.86■■□□□ 1.57
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.84■■□□□ 1.57
SDCCAG3-210ENST00000481114 SOGA1O94964 1423 aa24.82■■□□□ 1.56
SDCCAG3-210ENST00000481114 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SDCCAG3-210ENST00000481114 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3-210ENST00000481114 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.72■■□□□ 1.55
SDCCAG3-210ENST00000481114 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SDCCAG3-210ENST00000481114 WDR97A6NE52 1622 aa24.7■■□□□ 1.54
SDCCAG3-210ENST00000481114 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.67■■□□□ 1.54
SDCCAG3-210ENST00000481114 SYNJ1O43426 1573 aa24.66■■□□□ 1.54
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SDCCAG3-210ENST00000481114 CUX1P39880 1505 aa24.64■■□□□ 1.53
SDCCAG3-210ENST00000481114 GRIN2BQ13224 1484 aa24.63■■□□□ 1.53
SDCCAG3-210ENST00000481114 SYNJ2O15056 1496 aa24.58■■□□□ 1.52
SDCCAG3-210ENST00000481114 PBRM1Q86U86 1689 aa24.53■■□□□ 1.52
SDCCAG3-210ENST00000481114 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.51■■□□□ 1.51
SDCCAG3-210ENST00000481114 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.41■■□□□ 1.5
SDCCAG3-210ENST00000481114 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.4■■□□□ 1.5
SDCCAG3-210ENST00000481114 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SDCCAG3-210ENST00000481114 GRIN2AQ12879 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.28■■□□□ 1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 ADAMTS12P58397 1594 aa24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 CEP170Q5SW79 1584 aa24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 NUP160Q12769 1436 aa24.22■■□□□ 1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.17■■□□□ 1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 TOP2BQ02880 1626 aa24.16■■□□□ 1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 SHROOM2Q13796 1616 aa24.15■■□□□ 1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 JPH4Q96JJ6 628 aa24.02■■□□□ 1.44
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